PERMUTANTES CIRCULARES, COMPOSICIONES QUE LOS COMPRENDEN Y MÉTODOS DE USO DE LOS MISMOS

Solicitante

Inventores (2)

Clasificación Internacional de Patentes (IPC)

Resumen técnico

En el presente documento se describen permutantes circulares junto con composiciones y sistemas que comprenden los permutantes circulares. También se describen proteínas de fusión que incluyen un permutante circular, tales como proteínas de fusión que incluyen un permutante circular fusionado a un polipéptido de interés (por ejemplo, una desaminasa o transcriptasa inversa). Además se describen en el presente documento métodos de uso y/o producción de un permutante circular, tales como métodos de uso de un permutante circular para modificar o editar un ácido nucleico diana. Reivindicación 1: Un polipéptido que comprende un permutante circular de un Cas12a o una proteína diseñada genéticamente que comprende un polipéptido Cas12a (p. ej., un permutante circular de una o más de SEQ ID Nº 39 - 65, 69 - 132, 159 - 182, 281 - 284, 298, 400 - 401, 741, 761, y 850 - 861), donde el permutante circular se une a un ácido nucleico, opcionalmente donde el permutante circular tiene actividad de nucleasa. Reivindicación 20: Un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos que comprende por lo menos 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, o 100% de identidad de secuencia con respecto a una o más de SEQ ID Nº 234 - 245, 299 - 310, 351 - 362, 390 - 399, 450 - 461, 486 - 497, 537 - 560, 609 - 639, 702 - 704, 735 - 740, y 757 - 760. Reivindicación 21: Un polipéptido que comprende una primera secuencia de aminoácidos que tiene por lo menos 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, o 100% de identidad de secuencia con respecto a una porción de una de SEQ ID Nº 39 - 65, 69 - 132, 159 - 182, 281 - 284, 298, 400 - 401, 741, 761, y 850 - 861, donde la porción de aquella de SEQ ID Nº 39 - 65, 69 - 132, 159 - 182, 281 - 284, 298, 400 - 401, 741, 761, y 850 - 861 incluye el extremo N-terminal de aquella de SEQ ID Nº 39 - 65, 69 - 132, 159 - 182, 281 - 284, 298, 400 - 401, 741, 761, y 850 - 861 y menos que la secuencia de aminoácidos entera de SEQ ID Nº 39 - 65, 69 - 132, 159 - 182, 281 - 284, 298, 400 - 401, 741, 761, y 850 - 861, y el extremo N-terminal de aquella de SEQ ID Nº 39 - 65, 69 - 132, 159 - 182, 281 - 284, 298, 400 - 401, 741, 761, y 850 - 861 está en o después del residuo de aminoácido 70 del polipéptido. Reivindicación 41: Un complejo que comprende: el polipéptido de cualquiera de las reivindicaciones 1 - 40; y un ácido nucleico guía. Reivindicación 51: Un casete de expresión optimizado por codones para la expresión en un organismo, que comprende: un polinucleótido que codifica una secuencia de promotor, y un polinucleótido que tiene por lo menos alrededor de 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, o más identidad de secuencia con respecto a una o más de SEQ ID Nº 247 - 258, 286 - 297, 327 - 338, 364 - 375, 402 - 411, 462 - 473, 503 - 514, 561 - 584, 640 - 670, 706 - 708, 742 - 747, 763 - 766, 784, y 787, y/o que codifica un polipéptido que tiene por lo menos alrededor de 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, o más identidad de secuencia con respecto a una o más de SEQ ID Nº 234 - 245, 299 - 310, 351 - 362, 390 - 399, 450 - 461, 486 - 497, 537 - 560, 609 - 639, 702 - 704, 735 - 740, y 757 - 760, opcionalmente donde el polinucleótido que codifica el polipéptido está optimizado por codones para la expresión en el organismo. Reivindicación 54: Un método para modificar un ácido nucleico diana en una célula, donde el método comprende: introducir el casete de expresión de cualquiera de las reivindicaciones 51 - 53 en la célula, a fin de modificar así el ácido nucleico diana en la célula. Reivindicación 57: Un método para producir un polipéptido, donde el método comprende: cultivar una célula o grupo de células que han sido transformadas con un ácido nucleico que codifica un polipéptido que tiene por lo menos alrededor de 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, o más identidad de secuencia con respecto a una o más de SEQ ID Nº 234 - 245, 299 - 310, 351 - 362, 390 - 399, 450 - 461, 486 - 497, 537 - 560, 609 - 639, 702 - 704, 735 - 740, y 757 - 760; y aislar dicho polipéptido (p. ej., aislar por diálisis, centrifugación, purificación de columna y/o similares), a fin de producir así el polipéptido. Reivindicación 58: Un método para modificar un ácido nucleico diana, donde el método comprende: poner en contacto el ácido nucleico diana con: el polipéptido de cualquiera de las reivindicaciones 1 - 40; y un ácido nucleico guía, a fin de modificar así el ácido nucleico diana.